در تولیدات ارگانیک، کشاورزان ترجیح می‌دهند از برخی از ابزارهای شیمیایی که سایر کشاورزان از آنها استفاده می‌کنند بهره نبرند. طراحی و مدیریت سیستم تولید برای موفقیت مزرعه حیاتی است. شرکت‌هایی را انتخاب کنید که مکمل یکدیگر باشند و روش‌های خاک‌ورزی محصول را برای جلوگیری یا کاهش مشکلات محصول انتخاب کنید.
بازده هر محصول ارگانیک بسته به میزان توانایی‌های مدیرْ متفاوت است. در طی انتقال از کشاورزی متعارف به کشاورزی آلی، بازده تولید کمتر از سطح معمول است، اما پس از یک دورۀ گذار سه تا پنج ساله بازده آلی به طور معمول افزایش می‌یابد.
محصولات غلات و علوفه به دلیل فشارهای نسبتاً کم آفات و نیاز به مواد مغذی، می توانند به راحتی از نظر ارگانیک رشد کنند. دانه‌های سویا نیز عملکرد خوبی دارند اما علف‌های هرز می‌تواند چالشی سخت باشد. ذرت بیشتر در مزارع ارگانیک کشت می‌شود اما نیاز به مدیریت دقیق کنترل علف‌های هرز و باروری آن است. تأمین نیازهای ذرت به ویژه چالش برانگیز است. ذرت را می‌توان با موفقیت بعد از حبوبات علوفه‌ای و یا کود دامی استفاده کرد. بازارهای غلات خوراکی آلی در سال‌های اخیر بسیار قدرتمند بوده است.
